Можно ли размещать газовый котел,работающий на попутном газе в отдельном помещение, в операторной бункерного исполнения?

В подвале нельзя! Если плотность газа больше плотности воздуха, то датчики загазованности ставят внизу.

Операторная находиться над землей,но в бункерном исполнение и у нее нет окон,а по норм должно быть остекление 0,03 от объема помещения. вот и вопрос в том распространяються ли нормы на остекление в данном случаи

Окна или легкосбрасываемые конструкции устанавливаются обязательно, т.к. выполняют роль взрывных клапанов.

Вместо оконого проема можно воспользоваться клапаном избыточного давления в стене?

Вы сначала посчитайте требуемую площадь легкосбрасываемых конструкций. Затем площадь одного клапана. Поделите одно на другое, получите количество клапанов. И сами не захотите их ставить.