В квартире пятиэтажного дома без централизованного отопления и ГВС, Дымовой канал расположен в санузле. Газовый котёл стоит на кухне (смежное помещение).
В СП 402.1325800.2018 Приложение Г прописано что "Г.23 Не допускается прокладывать дымоходы и дымоотводы через жилые помещения, ванные комнаты и санитарные узлы."
Есть ли какие-нибудь требования для устройства дымоотвода транзитом через санузел или это жёсткое правило? Что делать в подобном случае?

Это не для котла.
Там раньше газовая колонка стояла для подогрева воды. ИМХО скорее всего

ПС да запрет "жесткий"

Если объект введён в эксплуатацию до вступления в силу СП 402, то требования этого СП не распространяются на него

Вы сообщили недостаточное количество информации, и Ваши потенциальные советчики пытаются что-то угадать - это неконструктивно.
Для получения понятного ответа надо указать подробности:
- какого года постройки дом;
- котёл вновь устанавливаемый или существовал по изначальному проекту;
- дымоход существующий или Вы хотите подключиться к существующему вентканалу в с/у