Мы эксплуатируем котельную (теплогенераторную на 1 дом), есть своя газовая служба,в теплогенераторной 2 котла бытовые мощностью 30кВт, один заменили зимой на такой же мощностью ,но другой фирмы ( меняли сами своей службой). Какие то акты (документы)нам надо составить чтобы проблем с газовиками не было.

должен быть наряд на замену котла

Нужно было запросить разрешение у газоснабжающей организации на замену. Попоробуйте их хотя бы уведомить.
Надо написать ещё одно письмо в Межрегионгаз (если вы догоовр с ними заключаете на поставку газа), но там только в форме уведомления, последствий не будет.

С какими газовиками не должно быть проблем, если газовая служба - своя?